Om inzicht te krijgen in de mogelijke risico’s van microcystines in zwemwateren is eenduidige monstername en analysemethodiek noodzakelijk. Op verzoek van de werkgroep Cyanobacteriën heeft STOWA Waternet opdracht gegeven een eenduidige en optimale methode te ontwikkelen voor het vaststellen van de concentratie mycrocistine in oppervlaktewater (i.c. monsterneming, extractie en analyse).

Het onderzoek (2009-21) heeft geresulteerd in een bemonsteringsprotocol (2009-21A) en een analyseprotocol (2009-21B) voor microcystine onderzoek. Deze protocollen worden als betrouwbaar beschouwd voor oppervlaktewater met Microcystis en Planktothrix dominantie, twee veelvoorkomende typen cyanobacteriën.